Она предназначена для управления работой высокопроизводительных компьютеров — корпорация в особенности хочет заполучить себе клиентов из финансовой сферы, испытывающей сейчас серьезные проблемы. В секторе высокопроизводительных систем доминирует операционная система Linux, и Microsoft придется постараться, чтобы отвоевать себе место. Предыдущая система Microsoft для этого сегмента продавалась под названием Windows Compute Cluster Server 2003, а начало она берет от одного из проектов, реализованных в Microsoft Research. Операционная система HPC Server 2008 основана на 64-разрядном варианте Windows Server 2008. В ней реализована поддержка высокоскоростных сетей, средства администрирования кластеров, управление заданиями на основе сервис-ориентированной архитектуры и поддержка разных кластерных файловых систем. Система способна масштабироваться на тысячи процессорных ядер, в ней реализован разработанный в Microsoft новый интерфейс сетевого прямого доступа к памяти NetworkDirect RDMA. Поддерживаются стандарты совместимости кластеров, в том числе спецификация Open Grid Forum High Performance Computing Basic Profile.